1969년 12월에 발생한 북한의 대한항공 납치사건도 이러한 북한의 남한사회 흔들기의 일환이었다. 북한은 고정간첩을 통해 대한항공을 공중납치하고, 자진월북이라고 정치선전을 늘어 놓았다. 한국 정부는 국제 접십자 조직 등을 통해 승객·승무원의 무사귀환을 위해 노력했다. 북한은 결국 조종사 등 일부를 억류한 채 37명만을 귀환시켰다.

KAL기 납북사건이 발생하자 한국 정부는 미국 등 우방과 국제적십자사 등 국제기구를 통해 납북된 KAL기의 인원과 기체의 조속한 송환을 위해 노력하였다. 박정희 정부는 이 사건을 휴전 위반과 인도주의 차원에서 접근하면서,군사정전위원회 비서장 회의와 국제적십자위원회(ICRC) 및 각국 적십자사의 채널을 통해 승객·승무원의 무사 귀환을 위해 애썼다. KAL기 납북 후 북한이 제의한 남북한 5개단체 회의에 대해서는 정치적 대가를 받고자 하는 기도라며 거부 의사를 밝혔다.

1970년 2월 2일 군사정전위원회 비서장회의에서 북한이 이 문제에 대해 언급하지 않자, UNC측이 먼저 남북 양측 적십자사 대표로 하여금 KAL기 승무원·승객 및 화물을 인계·인수토록 하자고 제의하였다. 북한은 여하한 UNC의 제의도 전격적으로 거부하고, KAL기 송환은 미국의 간섭·방해 때문에 이루지 못하고 있다면서, 민간 대표 사이의 교섭을 통해 이 문제를 해결하여야 한다고 자신들의 입장을 밝혔다.

1970년 2월 3일 북한 적십자사는 제네바에 있는 국제적십자위원회(ICRC)에 장문의 전문을 보냈다. 이 전문에서 북한은 남한의 민간단체 대표가 판문점에 올 수 없는 상황에서 승객 희망에 따라 조속히 돌려보내기 위해 북한 당국이 일방적 조치를 취할 것임을 밝혔다. 북한은 납치 55일만에 승객 송환을 통보하고, 1970년 2월 14일 조종사 등 12명을 억류한 채 37명만을 송환하였다.