한국과 미국 사이의 군원이관 논의는 1959년 당시 송인상 재무장관과 맥그루더 유엔군 사령관 사이의 합의에서 출발하였다. 동 합의는 한국에서의 경제성장률이 5% 이상이 될 경우 군원이관을 실시할 것이라고 규정하였다. 이 합의에 따라 군원이관은 1966년까지의 완료를 목표로 1960년에 개시되었다. 1959년 당시에 합의된 〈군원이관 계획〉은 1960년부터 1966년까지 7년간에 거쳐 약 6000만 달러 상당액의 소비 물자의 조달책임을 연차적으로 한국 정부에 이관하도록 규정하였다. 실제로 미국은 1960년과 61년에 거쳐 군사원조프로그램(MAP) 가운데 천 2백만 달러 정도의 기초품목이 MAP에서 한국국방 예산으로 이관되었다. 또한 회계연도 1961년을 시작으로 주로 의복류에 해당하는 품목이 천 2백만 달러에서 천 5백만 달러 수준으로 이관 품목에 포함되었다. 나아가 회계연도 1962년에서 1967년 사이에 설정된 〈군원이관 계획〉은 한국에서 생산 가능한 상업 유형의 소모품에 대하여 매년 3천 6백만 달러 수준에 해당하는 군원이관을 목표로 하였다.

하지만 이러한 일시중단이 군원이관의 전면 중지를 의미하는 것은 아니었다. 미국은 1963년 3월 8일에 주한미국대사를 통하여 회계연도 1964년부터 다시 군원이관을 재개하겠다고 한국에 통보하였다. 또한 미국은 1970년까지의 완료를 목표로 한 〈군원이관 계획〉을 설정하였다. 이에 대해 한국은 군원이관 중단에 대하여 담당 주관부서인 국방부와 경제기획원을 중심으로 대응책을 모색하였다. 이러한 대응책은 미국의 군원이관이 지속될 것이라는 것을 전제로 이관계획 기간의 연장, 이관량의 조절, 이관 품목 순위의 조정 그리고 이관품목의 대체 등의 내용을 담고 있었다.

물론 이러한 대응책을 마련하면서도 한국은 지속적으로 미국에 군원이관을 유보하여 줄 것을 요청하였다. 이러한 교섭 과정에서 한국은 자신의 경제상황이 미국이 평가하는 것보다 심각하게 좋지 않다는 점과 군원이관이 야기할 국방비 증가와 세수 부담 증대 그리고 이에 따른 경제개발계획 수행에 있어서의 어려움을 강조하였다. 실제로도 1963년 말의 한국 정세는 한국 정부에 어려움을 야기하였다. 당시 한국은 식량 부족은 물론 군원 이관에 의한 군사원조의 점차적 삭감 그리고 경제적 기반의 미숙으로 인한 국제경쟁력의 약화 등으로 어려운 상황에 직면하였다. 하지만 당시 한국 스스로도 전망한 바와 같이 미국은 군원 이관 방침을 고수하였다. 따라서 군원이관을 둘러싼 한국과 미국 사이의 이견은 1964년 말까지 지속되었다.

그런데 이러한 이견은 한국 전투 병력의 베트남 참전이 본격화되는 1965년에 이르러 해소되었다. 한국군 전투병 파병을 공식적으로 제안한 1965년 5월의 〈한·미 정상회담〉에서 미국은 주한미군 감축의 유보와 군원이관의 연차적 중지 그리고 한국에 대한 경제 및 군사 지원의 지속을 약속하였다. 또한 소위 ‘브라운 각서’라고 불리는 1966년 이동원 한국 외무장관과 브라운 주한 미국 대사 사이에 작성된 문서를 통하여서도 한국에 대한 경제적 및 군사적 지원은 다시 확약되었다. 1965년 5월의 정상회담을 기점으로 군원이관 중단이 결정된 것은 미국의 베트남전에 대해 적극적으로 호응하는 한국의 입지를 강화시키려는 맥락에서 이해될 수 있다. 물론 베트남전 파병을 자신의 국익을 달성하기 위한 카드로 활용한 한국의 의도가 통했다는 맥락으로도 이해될 것이다. 미국의 이러한 경제 및 군사적 지원 약속은 한국에 대한 지원을 축소하려는 케네디 행정부 이래의 미국 정부의 정책 방향을 뒤집는 것이라 할 수 있다. 그리고 이렇게 미국의 베트남 정책에 대한 한국의 적극적 편승이 지속되는 동안 군원 이전을 둘러싼 한미 간의 이견 역시 해소될 수 있었다.